生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/05/01 10:25:48
生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些首先,EST序列的测序,得到该基因的EST片段\r\n其次,生物信息

生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些
生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些

生物信息学构建分子系统发育树的主要方法有哪些
首先,EST序列的测序,得到该基因的EST片段\r\n其次,生物信息学,用Go或者KEGG,分析该基因的功能分类,所在代谢途径等;通过NCBI Blastn,BlastX,tBlastn等比对与该基因同源性较高的基因序列和可能功能;通过ExPASY研究蛋白的特点,二级结构,三级结构等.\r\n之后,根据已得到的信息,依据可能的功能设计细胞分子生物学实验,\r\n例如,1利用已知序列,通过RACE方法获得该基因的cDNA全序列,通过巢式PCR或者Tail PCR的方法获得全基因组序列及promotor序列\r\n2构建过表达载体,在生物体内过表达该基因,看是否获得可见表性\r\n 3构建反义RNA载体,或者RNAi载体,使该基因的表达沉默,看是否获得可见表性\r\n 4通过同源重组的方法,敲除该基因,看是否获得可见表性\r\n 5在该基因缺失的突变生物体中,过表达该基因,看表性能够得到互补t突变\r\n 6在该基因启动子后接上报告基因,观察该基因的表达位置\r\n 7在将该基因与报告基因后,进行亚细胞定位\r\n 8采用real-time-PCR的方法,观察该基因的表达模式\r\n 9采用基因芯片的方法,观察与该基因有关的基因\r\n 10采用酵母双杂交的方法,寻找与该基因相互作用的蛋白.\r\n 等等等等