生物信息学一些基本的常用软件有哪些

来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/04/30 11:44:02
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生物信息学一些基本的常用软件有哪些
序列拼接软件：velvet,SOAPdenvoo,SSAKE,ABySS,Trinity 等
短序列比对软件： bwa,bowtie,tophat,SOAPAligner 等
局部比对软件：Blast,blat,CorssMatch 等
多序列全局比对软件：Muscle,clustalw 等
基因预测软件：Glimmer,GeneMark,Augustus,FgeneSH,SNAP,GeneScan,EuGENE,Glean等
重复序列预测软件：RepeatMasker,TRF等
聚类软件：MCL,hcluster_sg等
统计软件：pLINK,TASSEL,R,SPSS等
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