单酶切问题单酶切大小约5000bp的质粒pcDNA3.1,电泳总是出现两条带,说是酶切不完全,调整成20ul体系,酶2ul,质粒8ul,buffer 4ul,结果仍是两条带,在5000bp左右,很相近.究竟什么问题,期待高人指点,酶用的
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/11 03:50:50
单酶切问题单酶切大小约5000bp的质粒pcDNA3.1,电泳总是出现两条带,说是酶切不完全,调整成20ul体系,酶2ul,质粒8ul,buffer 4ul,结果仍是两条带,在5000bp左右,很相近.究竟什么问题,期待高人指点,酶用的
单酶切问题
单酶切大小约5000bp的质粒pcDNA3.1,电泳总是出现两条带,说是酶切不完全,调整成20ul体系,酶2ul,质粒8ul,buffer 4ul,结果仍是两条带,在5000bp左右,很相近.究竟什么问题,期待高人指点,酶用的是TAKALA的Ssp1.
顺便想问酶切后的质粒要与目的片段连接,是否需要进行胶回收纯化呢.查有篇文献构建该质粒时并没提到胶回收纯化,新手很多问题都不大懂,感谢大家关注
单酶切问题单酶切大小约5000bp的质粒pcDNA3.1,电泳总是出现两条带,说是酶切不完全,调整成20ul体系,酶2ul,质粒8ul,buffer 4ul,结果仍是两条带,在5000bp左右,很相近.究竟什么问题,期待高人指点,酶用的
首先明确一个问题,你的这个酶切位点在这个质粒中是唯一的吗,也就是说你只想把这个质粒切开吗?看你的结果好象这种可能性大些,那样我觉得最有可能是梅切不完全,即切开的线形质粒会比未切开的质粒跑得慢但两条带很相近.
建议:首先电泳时要有原质粒作对照,这样你就可以确定跑得快的带是不是未完全切开的质粒了.其次想酶切完全,可延长梅切时间,看你的体系酶的量足够了,而且酶的量本身也不应大于1/10;只是不知梅切的时间.最后若是可以确定两条带中有一条是切开的,则可以利用胶回收纯化的方法得到所需的这一载体,在和目的片段连接,注意这时凝胶回收是必要的,但若两条带太相近,则可能切的时候难分离;若是改变实验条件最终完全梅切(只一条带,且和原质粒位置有差异),则可以用加热65度20分钟的(对于37度酶)方法将酶灭活直接用作连接载体即可,不用回收.
以上是假设你的载体这个酶切位点唯一的情况,若不是则会切下一小段片段,并且一定要凝胶回收才可得到连接载体.